Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms