Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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