Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17190V9GX38 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17190V9GX38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms