Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3bQ9Z321 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms