Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms