Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms