Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf1Q9Z1B8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms