Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Loxl3Q9Z175 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms