Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms