Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArcQ9WV31 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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ArcQ9WV31 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ArcQ9WV31 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ArcQ9WV31 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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ArcQ9WV31 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArcQ9WV31 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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