Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srd5a3Q9WUP4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms