Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms