Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb3Q9R1P1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms