Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod1Q9R0E2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms