Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms