Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC2

Plxnc1, Plexin-C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnc1Q9QZC2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnc1Q9QZC2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnc1Q9QZC2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms