Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exo1Q9QZ11 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms