Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apbb1Q9QXJ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms