Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Homer2Q9QWW1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Homer2Q9QWW1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms