Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms