Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms