Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ap3b2Q9JME5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap3b2Q9JME5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b2Q9JME5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms