Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlr5Q9JLF7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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