Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin3Q9JLB9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms