Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk3aQ9JKX8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms