Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6bQ9JK83 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6bQ9JK83 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms