Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tuba8Q9JJZ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tuba8Q9JJZ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tuba8Q9JJZ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tuba8Q9JJZ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Tuba8Q9JJZ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tuba8Q9JJZ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tuba8Q9JJZ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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