Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms