Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms