Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr12Q9JJA4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms