Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc9a3r2Q9JHL1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms