Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc9Q9JHI7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms