Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms