Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stx12Q9ER00 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx12Q9ER00 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms