Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SgshQ9EQ08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms