Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr1Q9EPQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr1Q9EPQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tlr1Q9EPQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms