Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms