Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms