Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rnf6Q9DBU5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rnf6Q9DBU5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf6Q9DBU5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms