Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG6

Rpn2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpn2Q9DBG6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpn2Q9DBG6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpn2Q9DBG6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms