Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms