Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PacrgQ9DAK2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PacrgQ9DAK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms