Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms