Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc4Q9D844 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc4Q9D844 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc4Q9D844 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc4Q9D844 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnajc4Q9D844 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms