Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn23Q9D7D7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms