Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbe1Q9D6Y9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms