Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4aQ9D6F9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms