Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem30cQ9D4D7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem30cQ9D4D7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms