Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms