Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UvssaQ9D479 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UvssaQ9D479 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms